前往调查地落在太平洋的不明飞行物的海上自卫队二尉-有恸贯文，突然遭遇到青色光芒，而在这光芒影响下其细胞产生异变而变成凶恶怪兽THEONE，之后他在防卫厅的特殊机关BCST(对生物恐怖活动研究机关)的监视下脱逃而失去踪迹，另一方面，航空自卫队F15J驾驶员-真木舜一，为了很和鲜有时间相处患有先天性绝症的儿子-继梦在一起,因而而决定辞职，在最后一次飞行时，真木在空中跟红色光芒在空中发生冲撞，此事跟THEONE事件相隔了3个月，但是真木奇迹的生还，然后转职成民航机飞行员，展开了新生活，对这样的真木还是有机关非常关注，尤其是BCST中的化学担当官-水原沙罗，BCST将真木强制带走，在废工厂中搭建的BCST研究室进行身体上的监视，此时行踪不明的怪兽THEONE像被某种东西吸引而回来了，遭受THEONE攻击而濒死的真木，身体发生了变化，在红色光球的力量之下变身了，变身成身高10M拥有银色光芒的钢铁身体型态，偶而还有自己意志的真木，跟THEONE展开作战,但是因为变身不完全，能量快速消耗，在遭到决定性的一击后变回了真木舜一的型态，然后沙罗将这个在THEONE之后出现的生命体定名为THENEXT，真木在从东京被护送回BCST研究室的途中得知了儿子继梦入院的消息，在赶到医院后跟妻子蓉子再次的碰面了，此时，人类最大的危机出现了，在吸收了各式各样的生物进入体内而产生变异的THEONE重返出现在新宿的街道上，从口中发出的的超绝火炎光弹将街道烧毁殆尽，有恸的人格已经被THEONE取代，已经成为不能变回为人的状态，不过那样的有恸以前与水原沙罗却是有着婚约的情侣，为了沙罗心中的回忆，并且为了跟儿子继梦的约定，为了保护心爱的家族，真木再次变身。那个姿态更加进化成巨大化40m，在间接部有像流血般的红色，两肘的特征是出现肘刀。，现在，以新宿副市中心为舞台，ULTRAMAN与"THEONE"的决战之火开始燃烧了！　　《奈克瑟斯奥特曼剧场版电影网友评论》