在不久的未来，世界已经被智脑公司所统治世界上的大多数人类都被智脑公司变成了怪人“俄尔以诺”，残存下来的人类仅有2433人，他们组成反抗军，以女主角园田真理为中心，躲在角落里苟延残喘。而假面骑士555是人类的救世主，其变身者乾巧，在智脑公司发动的总攻下被打败，目前生死不明。智脑公司为了对付余下的假面骑士凯撒，开发出了最强的假面骑士腰带“帝王腰带”。面对利用帝王腰带变身的强大邪恶假面骑士，反抗军无力对抗。难道人类真的就要就此灭绝了吗？心灰意冷的园田真理在空无一人的舞会上独自落泪，就在这时她的背后出现了一个一身白衣的男子，真理从他身上隐约看到了乾巧的影子。没错，他就是丧失了记忆的乾巧。巧和真理的命运在这孤独的世界中会走向何方？人类的救世主传说就此展开！